Ο σταθμός της Μυτιλήνης βρίσκεται έξω από την πόλη, σε απόσταση 4 km από το κέντρο της πόλης, στο λόφο του Πανεπιστημίου Αιγαίου, στο Εργαστήριο Δορυφορικής Μετεωρολογίας και Κλιματολογίας του Τμήματος Γεωγραφίας (http://www.aegean.gr/geography/gr/weather_gr/index.html). Το όργανο είναι τοποθετημένο στην οροφή του κτιρίου του Τμήματος Γεωγραφίας σε ύψος 80 μέτρων από την επιφάνεια της θάλασσας. Ο σταθμός περιβάλλεται από ελαιόδεντρα (δυτικά και νότια) και πεύκα (βόρεια και ανατολικά), ενώ βρίσκεται σε κοντινή απόσταση (500 μ) από τη θάλασσα (ανατολικά).
